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Persistent Identifier
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doi:10.25824/redu/86SMSY |
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Publication Date
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2026-08-10 |
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Title
| A topology-driven pipeline for the construction and comparative analysis of microRNA networks across breast cancer molecular subtypes |
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Alternative URL
| https://github.com/LIS-Unicamp/pan-cancer-analysis |
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Author
| Santos, Mylena Roberta dos (Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Computação) - ORCID: https://orcid.org/0009-0006-3168-980X
Geraldo, Murilo Vieira (Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia) - ORCID: https://orcid.org/0000-0002-9418-6103
Santanchè, André (Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Computação) - ORCID: https://orcid.org/0000-0002-1756-4852 |
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Point of Contact
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Santos, Mylena Roberta dos (Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Computação)
Santanchè, André (Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Computação) |
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Description
| This repository contains a topology-driven computational pipeline and derived data artifacts for the construction and comparative analysis of microRNA networks across breast cancer molecular subtypes. The pipeline encompasses data access, preprocessing, interaction inference, network construction, topological analysis, and comparative analysis of subtype-specific networks. Source code, reproducible implementation details, and documentation of the derived data artifacts are available in the GitHub repository listed in the metadata under “Alternative URL”. (2026-05-22) |
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Subject
| Computer and Information Science; Medicine, Health and Life Sciences |
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Keyword
| Network science
Network medicine
Comparative network analysis
Network topology
Network modeling
Bipartite network
MicroRNAs (BIREME (DeCS))
Cancer (DLC (LCSH)) |
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Language
| English |
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Funding Information
| Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo: FAPESP: 2024/14197-5
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior: CAPES: 88887.950665/2024-00 |
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Depositor
| Roberta, Mylena |
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Deposit Date
| 2026-05-22 |
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Declarações obrigatórias sobre ética e privacidade
| o projeto que gerou os dados foi aprovado pelo Comite de Ética em Pesquisa da Unicamp ou não envolve questões que requeiram tal aprovação; os dados que serão depositados estão de acordo com a LGPD (Lei Geral de Proteção de Dados) |